Et kulstofskelet er kovalent bundet til både en aminogruppe og en carboxylgruppe. Når det placeres i vand?

Når den er placeret i vand, vil en aminosyre:

* ionize: Carboxylgruppen mister en proton (H+) og bliver negativt ladet (COO-), mens aminogruppen får en proton og bliver positivt ladet (NH3+). Dette skyldes, at carboxylgruppen er sur, og aminogruppen er grundlæggende.

* opfører sig som en zwitterion: En zwitterion er et molekyle, der har både en positiv og negativ ladning. På grund af dens dobbelte ladninger vil aminosyren være i stand til at interagere med både polære og ikke-polære molekyler i vand.

* Form brintbindinger: De ladede grupper på aminosyren vil være i stand til at danne hydrogenbindinger med vandmolekylerne, hvilket gør det opløseligt.

Samlet set vil en aminosyre placeret i vand fungere som en zwitterion , at være opløselig og i stand til at interagere med både polære og ikke-polære miljøer.