De fleste skyer er i troposfæren. Uanset om det er cirrus, stratus eller cumulonimbus, skal du bruge vanddråber og/eller iskrystaller for at lave skyer. Så den relativt våde troposfære er et fantastisk miljø for dem. Men stratosfæren? Ikke så meget. I det store og hele er det bare for tørt til at lette skydannelsen.
Alligevel er skymanglen ikke nødvendigvis en dårlig ting. Stratosfæren kombinerer (stort set) skyfri himmel med begrænset turbulens, hvilket gør den attraktiv for flyselskabets piloter. Faktisk rammer de fleste kommercielle fly deres marchhøjder i stratosfærens lavere atmosfære. Når stratosfæriske skyer dannes, skabes de nogle gange ved blanding af is med vulkansk støv. Polarområderne ser også skyer på stratosfæreniveau om vinteren.