Tab af levesteder er den største trussel mod fuglene. Efterhånden som menneskelige befolkninger vokser, overtager vi mere og mere af deres naturlige habitat. Dette kan tvinge fugle til at leve i områder, der ikke er egnede til dem, hvor de måske ikke har adgang til mad eller husly. For eksempel har ødelæggelsen af vådområder ført til et fald i bestanden af vandfugle, såsom ænder og gæs.
Klimaændringer har også en negativ indvirkning på fuglebestandene. Stigende temperaturer får fugle til at flytte deres rækkevidde mod nord, og mange arter har svært ved at tilpasse sig det skiftende klima. For eksempel er nogle arter af sangfugle ikke længere i stand til at finde et levested i det nordlige USA, og deres bestande er faldende som følge heraf.
Forurening er en anden stor trussel mod fugle. Mange fugle bliver forgiftet af pesticider og andre kemikalier, der bruges i landbrug og industri. Andre bliver dræbt af olieudslip og andre former for forurening. For eksempel dræbte Deepwater Horizon-olieudslippet i Den Mexicanske Golf anslået 1 million fugle.
Andre faktorer som bidrager til faldet i fuglebestande omfatter ændringer i fødevaretilgængelighed, jagt og spredning af sygdom.
Faldet i fuglebestandene er et alvorligt problem. Fugle spiller en vigtig rolle i økosystemet, og deres tab kan have en ringvirkning på andre arter. For eksempel kan tilbagegangen af insektædende fugle føre til en stigning i insektpopulationer, som kan skade afgrøder og sprede sygdom.