Videnskab
 science >> Videnskab >  >> Kemi

Den tætteste ikke-aminoglykosidligand til det bakterielle ribosomale RNA A-sted

Kemisk struktur af ATMND-C 2 -NH 2 og sekvensen af ​​den bakterielle (Escherichia coli) A-sted-holdige RNA-model anvendt i denne undersøgelse. Det viser også den mulige struktur af komplekset mellem ATMND-C 2 -NH 2 (grøn farve) og intern løkke af A-stedet. Kredit:Seiichi Nishizawa

En forskergruppe ved Tohoku University har gjort en betydelig opdagelse med positive konsekvenser for udviklingen af ​​bakteriebekæmpende medicin. Aminoacyl-tRNA-stedet (A-stedet) i 16S RNA-afkodningsområdet i det bakterielle ribosom ser lovende ud for en ny æra med udvikling af antibiotika-lægemidler.

Traditionelle aminoglykosid-antibiotika er problematiske på grund af deres høje toksicitet og potentiale for resistensudvikling. Forskningen ved Tohoku University fokuserede på bakteriel A-site, der binder små ligander, hvis strukturer er forskellige fra aminoglycosidfamilien, som tilbyder potentiale for udvikling af nye lægemidler, der behandler bakterielle infektioner med en reduktion af problemerne forbundet med traditionelle antibiotika.

Forskergruppen ledet af Dr. Seiichi Nishizawa og Dr. Yusuke Sato (Kemisk Institut, Graduate School of Science) har rapporteret en ny lille ligand, ATMND-C 2 -NH 2 som har den strammeste bindingsaffinitet til det bakterielle A-sted blandt ikke-aminoglycosid-ligander.

ATMND-C 2 -NH 2 viser en signifikant fluorescerende quenching-respons ved selektiv binding til den indre sløjfe af det bakterielle (Escherichia coli) A-sted-holdige model-RNA.

ATMND-C 2 -NH 2 har også vist sig nyttig som en indikator til vurdering af ligand/A-sted interaktioner.

Resultaterne opnået af forskergruppen giver et rationelt grundlag for generering af nye A-site bindingsligander med henblik på nye antibiotika med mindre toksicitet og minimal resistensudvikling.