Et af PAMELAs primære mål er at søge efter mørkt stof, en hypotetisk stoftype, der ikke interagerer med elektromagnetisk stråling. Mørkt stof menes at udgøre en betydelig del af universet, men dets natur er ukendt. PAMELA kan søge efter mørkt stof ved at lede efter et overskud af positroner og elektroner i kosmiske stråler, som kunne frembringes ved udslettelse af mørkt stofpartikler.
PAMELA har endnu ikke opdaget et statistisk signifikant overskud af positroner og elektroner i kosmiske stråler, men det har sat øvre grænser for mængden af mørkt stof, der kan eksistere. Disse øvre grænser er baseret på antagelsen om, at mørkt stof partikler tilintetgøres til positroner og elektroner, men PAMELA er også følsom over for andre mørk stof annihilationskanaler.
Udover at søge efter mørkt stof har PAMELA også lavet en række andre vigtige observationer. Disse omfatter opdagelsen af en tidsafhængig modulation af den kosmiske stråleflux, som menes at være forårsaget af samspillet mellem kosmiske stråler og solvinden, og påvisningen af et højenergi-elektronspektrum, der kan skyldes pulsarer eller supernova-rester.
PAMELA fortsætter med at operere i kredsløb, og det forventes at fortsætte med at yde vigtige bidrag til vores forståelse af kosmiske stråler og mørkt stof i mange år fremover.