Brug af eDNA til at identificere ynglehabitat for truede arter

Ved hjælp af omfattende eDNA-analyse kombineret med traditionelle indsamlingsmetoder, Japanske forskere har identificeret ynglestedet for kritisk truede fiskearter Acheilognathus typus i hovedstrømmen ved Omono -floden i Akita Prefecture, Japan. Resultaterne blev offentliggjort den 14. november i onlineudgaven af Naturvidenskaben - Naturwissenschaften .

Undersøgelse af vandorganismer er en lang og besværlig proces, og dækker et bredt område medfører også høje omkostninger. Miljø -DNA (eDNA) analyse giver en løsning på disse spørgsmål. I undervandsmiljøer som f.eks. Søer reservoirer og floder, vi kan finde fragmenter af DNA, der driver i vandet fra afføring, hud eller enhver anden kilde til vandlevende organismer. Analyse af eDNA er særlig effektiv for sjældne arter som A. typus, hvilket er svært at finde gennem traditionelle undersøgelsesmetoder på grund af dens lave befolkningstæthed. I dette studie, forskergruppen gennemførte en omfattende eDNA-undersøgelse efterfulgt af en traditionel indsamlingsundersøgelse for at finde den nye ynglehabitat for A. typus i Omono-floden, Akita præfektur, Japan.

I tre dage i august 2016 indsamlede teamet overfladevandsprøver fra 99 steder, dækker 112 km fra Omono -floden, og ekstraherede eDNA fra prøverne. De målte DNA'et ved hjælp af et specifikt detektionssystem for A. typus. Efter dette, de placerede faste net og flaskefælder på steder, hvor eDNA var blevet påvist og bekræftede tilstedeværelsen af ​​voksne fisk. Holdet brugte også toskaller (hvor A. typus lagde æg) for at bekræfte, at de ynglede.

På de 99 lokaliteter ved den undersøgte Omono -flod, A. typus eDNA blev fundet 2 steder, og på et af disse steder tog teamet en han- og en hunprøve. Der blev fundet æg i toskallerne samme sted, så de var i stand til at identificere det som A. typus avlsstedet.

Disse resultater viser, at hvad angår omkostninger og pålidelighed, en kombination af eDNA -analyse og traditionelle indsamlingsmetoder er yderst effektiv til at identificere naturtyper og yngleområder for sjældne arter. Metoderne supplerer hinanden:eDNA -metoden er velegnet til at undersøge store områder, mens prøvetagning er meget pålidelig til bekræftelse af arter. Denne kombination af metoder kunne bidrage til at bevare denne art ved at finde flere yngleområder og etablere bevaringsområder. Det kan også bruges til andre sjældne og truede arter med en lav befolkningstæthed spredt over et stort område.