eDNA-værktøjet registrerer invasive muslinger, før de bliver til gene

Når man søger en kur mod en sygdom, tidlig opdagelse er ofte nøglen. Det samme gælder for eliminering af invasive arter. Det er vigtigt at identificere deres tilstedeværelse i en sø, før de er rigelige. En nylig undersøgelse fra University of Illinois brugte med succes miljø-DNA til at opdage invasive muslinger i Californien og Nevada søer. Forskere mener, at dette værktøj kan hjælpe med at identificere skadedyr, før de bliver et problem.

"Miljø-DNA, eller eDNA, betyder, at vi finder DNA'et fra et dyr eller en plante, som vi leder efter fra en miljøprøve, som vand, " siger U fra I akvatisk økolog Eric Larson. "Det er et værktøj i vækst, der har potentialet til at blive bedre til at opdage sjældne arter i nogle tilfælde, i forhold til nogle af vores mere traditionelle undersøgelsesmetoder. Der flyder en masse DNA rundt i en sø eller et vandløb, og hvis vi kan fange og identificere det, det kan fortælle os, hvilke organismer der er til stede, inklusive invasive arter."

Larson og kolleger fra Rice University, universitetet i Notre Dame, og University of Nevada i Reno udviklede en type laboratorieanalyse kaldet en eDNA-analyse for at teste for tilstedeværelsen af Corbicula , en invasiv ferskvandsmusling. Larson siger, "Vi fandt eDNA for Corbicula i fire af 11 søer, hvor vi allerede vidste, at det eksisterede, inklusive Lake Tahoe, og fandt ikke eDNA af muslingen i syv andre søer, hvor den aldrig var blevet fundet. Placeringen af Corbicula eDNA i Lake Tahoe matchede også tæt, hvor vi ved, at muslingerne er. Så disse resultater bekræftede, at analysen fungerer godt, og at det kunne være nyttigt til at overvåge nye populationer af denne angriber, mens den fortsætter med at sprede sig."

siger Larson Corbicula er meget almindelig i Europa og USA, men de er ikke overalt endnu. Muslingerne, som oprindeligt kommer fra Østasien, er ikke særlig store, men kan have store effekter på ferskvandsøkosystemer som søer og floder. Ikke markeret, de bliver invasive, og kan endda tilstoppe rør og beskadige infrastruktur, svarende til virkningerne observeret for andre invasive arter som zebra- og quaggamuslinger i De Store Søers Område.

" Corbicula fast etableret i Lake Tahoe i 2007, " siger University of Nevada akvatisk økolog og studie medforfatter Sudeep Chandra. "De påvirker vandkvaliteten og reducerer den bemærkelsesværdige klarhed i det nærliggende habitat ved Lake Tahoe. Ved at genbruge og udskille næringsstoffer, de invasive muslinger bidrager til væksten af ​​kystnære alger. Så at opdage dem omkring søen er afgørende for at forstå, hvor muslingerne vil forringe vandkvaliteten."

De invasive muslinger forekommer endda i Larsons baghave i Champaign, Illinois. "De er meget karakteristiske og er hyper-rigtige i det centrale Illinois, " siger Larson. "Hvis du ser en masse små hvide skaller på bækken, det er sandsynligvis Corbicula ." Larson fortsætter sit laboratoriums eDNA-forskning om Corbicula i disse vandløb i det centrale Illinois. "Fordi vi nu ved, at eDNA-analysen fungerer godt, vi ønsker at anvende det på nogle andre spørgsmål, " siger Larson. "Er der det bedste tidspunkt på året at bruge eDNA til at opdage denne angriber? Hvis vi ikke kan finde deres DNA om vinteren, stiger det om sommeren? Mobiliserer oversvømmelser meget DNA, gør det nemt at opdage, eller fortynder oversvømmelse det DNA, der er der?" Larson håber, at svar på disse yderligere spørgsmål vil hjælpe ledere og forskere med at finde og reagere på nye Corbicula invasioner andre steder, før de bliver problematiske.

Studiet, "Udvikling og feltvalidering af et miljø-DNA (eDNA) assay for invasive muslinger af slægten Corbicula " er online i bladet Håndtering af biologiske invasioner . Artiklen er hovedforfatter af Dominique A. Cowart, en U af I postdoc-forsker, og medforfatter af Mark A. Renshaw, Crysta A. Gatnz, og David M. Lodge fra University of Notre Dame, Scott P. Egan fra Rice University, og John Umek og Sudeep Chandra fra University of Nevada Reno.