Forskellen mellem genomisk DNA-ekstraktion mellem dyr og plante

Strukturen af ​​dobbeltstrenget DNA er universelt i alle levende celler, men forskelle forekommer i metoderne til ekstraktion af genomisk DNA fra dyre- og planteceller. Selvom genomisk DNA lever i cellerne, afhænger mængden og renheden af ​​ekstraheret DNA af cellens type og størrelse. For eksempel indeholder visse celler mere DNA og urenheder end andre. Læs videre for at lære mere om DNA-ekstraktionsforskelle.

Generel DNA-ekstraktion

Hvis du behandler plante- og dyreceller med sæbevand, vil det nedbryde lipiderne i cellen og kernemembraner. Derefter adskilles DNA-blandingen fra cellemembraner og proteiner. Dernæst kan du bruge alkohol til at udfælde DNA'et i opløsningen. Afhængigt af mængden i prøven kan DNA være synligt med det blotte øje. Husk dog, at denne enkle procedure ikke nødvendigvis producerer DNA med høj renhed.

Planter og dyrceller

Planteceller adskiller sig fra dyreceller på grund af deres stive cellevæg og organeller som kloroplast. De indeholder også proteiner og enzymer, der spiller en rolle i fotosyntese. Nogle planteceller har polyploidi, hvilket betyder at de har mere end en kopi af hvert kromosom pr. Celle. Derudover producerer cellulære processer, der forekommer i planter som fotosyntese en række sekundære metabolitter. Dyreceller har ikke en cellevæg, men har stadig brug for kemikalier som natriumdodecylsulfat (SDS) for at forstyrre cellemembranen for at frigive genomisk DNA.

Plant DNA-ekstraktion

Plantens DNA er mere svært at ekstrahere på grund af plantens cellevæg. Du kan fjerne det ved homogenisering eller ved at tilføje cellulase for at nedbryde den cellulose, der udgør cellevæggen. Desuden kan de metabolitter, der er til stede i plantecellen, interferere med genomisk DNA-ekstraktion ved at forurene DNA-prøven under udfældningsprocessen.

Animal DNA-ekstraktion

Perifere blodleukocytter er hovedkilden til dyr genomisk DNA, men prøveindsamling er vanskelig, fordi blodet skal komme direkte fra dyret. Blod indeholder en række forbindelser som proteiner, lipider, hvide blodlegemer, røde blodlegemer, blodplader og plasma, som kan forurene DNA-prøven. Den primære kontaminant af animalsk DNA, der ekstraheres fra blodprøver, er imidlertid hæmmet, hvilket er den ikke-proteinkomponent i hæmoglobin.

DNA-forskellene

Forskellene mellem plante- og dyre-DNA ligger i sekvens af baser i helixen. Forbindelser fundet i planteceller er fraværende i dyreceller, og DNA-basesekvenser afspejler dette. Det genomiske planted DNA er også ofte større end animalsk DNA. Disse forskelle påvirker også ekstraktionsmetoder, udbytte og renheden af ​​DNA.