Oprindelsen af Dimorphos er endnu ikke endeligt fastslået af videnskabsmænd. En teori antyder, at Dimorphos og Didymos engang var et enkelt kosmisk objekt, der tidligere oplevede en energisk kollision, hvilket fik proto-Didymos-systemet til at bryde op i to adskilte legemer. En anden teori foreslår, at asteroiderne aldrig var et enkelt objekt, men i stedet dannet uafhængigt inden for det samme himmelske kvarter og udviklede sig til at være gravitationsbundet over tid.