Ny teknik til at fange kortlivede RNA-molekyler afslører, hvordan gentranskription er koordineret i celler

Forskere har udviklet en ny teknik, der giver dem mulighed for at indfange og studere kortlivede RNA-molekyler, hvilket giver ny indsigt i, hvordan gentranskription koordineres i celler.

RNA-molekyler er essentielle for genekspression, og fungerer som budbringere, der bærer genetisk information fra DNA til cellens proteinfremstillingsmaskineri. Nogle RNA-molekyler er dog meget kortlivede og eksisterer kun i få sekunder eller minutter, hvilket gør dem udfordrende at studere.

Den nye teknik, kaldet SLAM-seq (for Short-Lived RNA Analysis by Mate-Pair Sequencing), overvinder denne udfordring ved at bruge en kombination af kemisk mærkning og high-throughput sekventering til at fange og identificere kortlivede RNA-molekyler.

Ved hjælp af SLAM-seq var forskere i stand til at identificere tusindvis af kortlivede RNA-molekyler i menneskelige celler og analysere deres ekspressionsmønstre. De fandt ud af, at disse kortlivede RNA'er er involveret i en række cellulære processer, herunder cellevækst, differentiering og apoptose.

Forskerne opdagede også, at ekspressionen af ​​kortlivede RNA'er er tæt koordineret med aktiviteten af ​​RNA-polymerase II, enzymet, der transkriberer DNA til RNA. Dette tyder på, at kortlivede RNA'er spiller en vigtig rolle i reguleringen af ​​gentranskription.

Den nye teknik giver et kraftfuldt værktøj til at studere kortlivede RNA'ers rolle i cellulære processer og kan føre til udviklingen af ​​nye terapier for sygdomme, der er forårsaget af forstyrrelser i RNA-metabolismen.

Undersøgelsen er publiceret i tidsskriftet Nature.