1. Aktivering af DNA-skade reaktionsveje: DNA-beskadigelse udløser aktiveringen af DNA-skadereaktionsveje, såsom ATM (ataxia-telangiectasia mutated) og ATR (ataxia-telangiectasia og Rad3-relaterede) veje. Disse veje fører til phosphorylering af forskellige proteiner, herunder transkriptionsfaktorerne p53 og BRCA1.
2. Transskriptionsanholdelse: DNA-skade kan forårsage standsning af igangværende transkription. Dette opnås ved phosphorylering af RNA-polymerase II ved hjælp af ATM- og ATR-vejene. Fosforylering af RNA-polymerase II hæmmer dets aktivitet og fører til dissociering af transkriptionsmaskineriet fra DNA-skabelonen.
3. Induktion af DNA-skade-responsive gener: DNA-skade inducerer transkriptionen af et specifikt sæt gener kendt som DNA-skade-responsive gener. Disse gener er involveret i DNA-reparation, cellecykluskontrolpunktkontrol og apoptose. Transskriptionen af disse gener medieres ofte af de aktiverede transkriptionsfaktorer p53 og BRCA1.
4. Ændringer i kromatinstruktur: DNA-skader kan inducere ændringer i kromatinstrukturen, hvilket kan påvirke gentranskriptionen. For eksempel kan DNA-skader føre til dannelse af DNA-dobbeltstrengsbrud, som kan forstyrre kromatinets normale struktur og gøre det utilgængeligt for transskriptionsmaskineriet.
Samlet set forårsager DNA-skade en kompleks og dynamisk respons i gentranskription, som er essentiel for at opretholde genomets integritet og forhindre celledød.