* Genekspressionsregulering: Produktionen af signalmolekyler reguleres på transkriptionsniveau. Specifikke transkriptionsfaktorer, proteiner, der styrer genekspression, kan aktivere eller undertrykke gener, der koder for signalmolekyler baseret på den cellulære kontekst og udviklingsstadiet.
* Ændringer efter oversættelse: Når først de er produceret, kan signalmolekyler gennemgå forskellige post-translationelle modifikationer, der påvirker deres aktivitet eller stabilitet. Disse modifikationer kan blandt andet omfatte glycosylering, phosphorylering og proteolytisk spaltning.
* Protein-protein-interaktioner: Aktiviteten af signalmolekyler kan moduleres af deres interaktioner med andre proteiner. For eksempel kan bindingen af specifikke proteiner til et signalmolekyle enten forbedre eller inhibere dets signaleringsevne.
* Signaltransduktionsveje: Signalmolekyler initierer cellulære responser ved at aktivere specifikke signaltransduktionsveje. Disse veje involverer en række biokemiske begivenheder, der transmitterer signalet fra celleoverfladen til kernen, hvor genekspressionsændringer forekommer.
* Feedback-løkker: Mange signalveje inkorporerer feedback-mekanismer, der hjælper med at finjustere den cellulære respons og sikre det passende niveau af differentiering. Positive feedback-loops forstærker signalet, mens negative feedback-loops dæmper det.
* Ekstracellulær matrix og celle-celle interaktioner: Sammensætningen af den ekstracellulære matrix og interaktioner mellem celler spiller også roller i at kontrollere signalmolekyleaktivitet. De kan påvirke diffusionen og præsentationen af signalmolekyler samt modulere målcellernes reaktionsevne.
* Miljømæssige signaler: Tilgængeligheden af vækstfaktorer, hormoner og andre ekstracellulære signaler i mikromiljøet kan direkte eller indirekte påvirke produktionen og aktiviteten af signalmolekyler involveret i celleskæbnebestemmelse.
Gennem disse kontrolmekanismer sikrer celler, at de passende signalmolekyler produceres, udskilles og modtages på det rigtige tidspunkt og sted for at dirigere deres differentiering til de nødvendige celletyper. Denne koordination er afgørende for den korrekte udvikling af væv, organer og i sidste ende hele organismen. Afbrydelse af disse kontroller kan føre til udviklingsmæssige abnormiteter, sygdomme og forskellige former for kræft.