* Mangel på kommunikation mellem bureauer. DHS, Department of Health and Human Services (HHS) og andre agenturer involveret i familieadskillelsespolitikken kommunikerede ikke effektivt, hvilket førte til forvirring og forsinkelser i genforeningsbestræbelserne.
* Mangel på ressourcer. DHS og HHS havde ikke de ressourcer, de havde brug for til hurtigt og effektivt at genforene familier, inklusive mangel på personale, finansiering og faciliteter.
* Logistiske udfordringer. Familiesammenføring var logistisk komplekst, da mange forældre og børn befandt sig i forskellige lande eller allerede var blevet løsladt fra varetægtsfængslet.
* Juridiske udfordringer. Trump-administrationen stod over for juridiske udfordringer i forhold til sin familieadskillelsespolitik, hvilket forsinkede genforeningsbestræbelserne.
I juni 2021 var der stadig 400 familier, der ikke var blevet genforenet, ifølge American Civil Liberties Union (ACLU). Biden-administrationen har gjort det til en prioritet at genforene disse familier, men det er en kompleks proces, der vil tage tid.