Nuklear dimorfi er et fænomen, hvor kroppens celler har to typer kerner. Dette forekommer oftest i protisters livscyklusser, såsom visse encellede alger og protozoer. En af disse kerner er den vegetative eller trofiske kerne, som styrer somatiske funktioner såsom vækst, reproduktion og cellulær metabolisme. Den anden kerne er den generative, seksuelle eller reproduktive kerne, som er ansvarlig for gametdannelse. Nuklear dimorfi er ofte forbundet med seksuel reproduktion og er afgørende for produktionen af haploide kønsceller i mange protistarter.