Cellestruktur: Arkæer og bakterier er prokaryote organismer, hvilket betyder, at de mangler en kerne og andre membranbundne organeller. Andre riger, såsom protister, svampe, planter og dyr, er eukaryote og har veldefinerede membranbundne kerner og specialiserede organeller.
Fravær af kloroplaster og mitokondrier: Arkæer og bakterier besidder ikke kloroplaster eller mitokondrier, som er essentielle organeller for fotosyntese og energiproduktion i henholdsvis planter og dyr. Archaea er typisk afhængig af fermentering eller anaerob respiration til energiproduktion, mens nogle bakterier kan bruge fotosyntese eller aerob respiration.
Unik cellevægsammensætning: Archaea har en unik cellevægssammensætning sammenlignet med bakterier. Mens bakteriecellevægge indeholder peptidoglycan, kan arkæale cellevægge indeholde pseudomurein eller andre unikke polymerer. Denne forskel i cellevægsstruktur har taksonomisk betydning og implikationer for antibiotikafølsomhed.
Ekstrem miljøtilpasning: Archaea er kendt for deres evne til at trives i ekstreme miljøer, såsom varme kilder, sure søer eller hydrotermiske åbninger på havbunden. Nogle bakterier er også tilpasset ekstreme forhold, men alsidigheden af archaea i deres miljøområde er bemærkelsesværdig.
Genetisk variation: Arkæer og bakterier udviser betydelig genetisk diversitet og variation i deres genomer, hvilket bidrager til deres tilpasningsevne og overlevelse i forskellige økosystemer. Deres genetiske karakteristika og evolutionære forhold adskiller dem ofte fra andre riger.
Metabolisme og energiopsamling: Arkæer og bakterier viser en bred vifte af metaboliske veje og energigivende mekanismer. Denne mangfoldighed afspejles i deres evne til at udnytte en række forskellige substrater til vækst og overlevelse. De omfatter ekstremofiler, fototrofer, kemoautotrofer og forskellige symbiotiske forhold.
Sammenfattende er archaea og bakterier forskellige fra andre kongeriger på grund af deres prokaryote natur, unikke cellevægssammensætning, forskellige metaboliske evner og tilpasningsevne til ekstreme miljøer. Disse karakteristiske træk understreger deres særskilte evolutionære veje og bidrager til deres økologiske betydning.