Aceto-orcein er et vigtigt farvestof, der almindeligvis bruges til at farve kromosomer i både plante- og dyreceller. Det har en høj affinitet for DNA på grund af dets grundlæggende natur og kan selektivt binde til fosfatgrupperne i DNA-rygraden. Når de farves med aceto-orcein, udviser kromosomerne et karakteristisk båndet udseende med skiftevis mørke (heterochromatin) og lyse (euchromatin) bånd. Dette båndmønster er afgørende for cytogenetiske undersøgelser, da det giver mulighed for identifikation og karakterisering af individuelle kromosomer.
Aceto-orcein-farvning er en enkel og alsidig teknik, der kan anvendes på både mitotiske og meiotiske kromosomer. Det er meget udbredt i cytologi, genetik og planteavl til karyotypeanalyse, kromosomidentifikation og påvisning af kromosomabnormaliteter eller omlejringer.