Mens Archaea og bakterier begge er prokaryoter (enkeltcellede organismer uden en kerne), er de forskellige livsområder. De deler en fælles stamfar, men divergerede milliarder af år siden.
Her er en sammenbrud:
* archaea findes ofte i ekstreme miljøer som varme kilder, saltsøer og hydrotermiske ventilationsåbninger. De har unik biokemi og genetik sammenlignet med bakterier.
* bakterier er meget mere forskellige og udbredte, findes i en lang række miljøer. De spiller vigtige roller i økosystemer, herunder nedbrydning, næringsstofcykling og forskellige industrielle processer.
Den nuværende forståelse af livets træ placerer archaea og bakterier som separate grene, begge lige så langt fra Eukarya (som inkluderer planter, dyr, svampe og protister).