1. Autotrofer: Disse bakterier producerer deres egen mad fra uorganiske kilder, der ligner planter. De er yderligere opdelt i:
* fotoautotrofer: Brug sollys som deres energikilde, konverter det til kemisk energi gennem fotosyntesen. Eksempler inkluderer cyanobakterier.
* kemoautotrofer: Få energi fra oxidation af uorganiske forbindelser som hydrogensulfid, ammoniak eller jernholdigt jern. Eksempler inkluderer svovl-oxidering af bakterier og nitrificerende bakterier.
2. Heterotrophs: Disse bakterier opnår deres næringsstoffer fra organiske forbindelser produceret af andre organismer. De er yderligere opdelt i:
* kemoheterotrofer: Få energi fra nedbrydningen af organiske forbindelser. Dette er den mest almindelige ernæringsmåde i bakterier. Eksempler inkluderer dekomponere, patogener og mange andre.
* fotoheterotrofer: Brug sollys til energi, men kræver stadig organiske forbindelser som deres kulstofkilde. Disse er mindre almindelige end andre typer.
Her er en tabel, der opsummerer de forskellige typer bakteriel ernæring:
| Ernæringstype | Energikilde | Kulstofkilde | Eksempler |
| --- | --- | --- | --- |
| fotoautotroph | Lys | CO2 | Cyanobacteria |
| kemoautotroph | Uorganiske forbindelser | CO2 | Svovl-oxidering af bakterier, nitrificerende bakterier |
| kemoheterotrof | Organiske forbindelser | Organiske forbindelser | Nedbrygere, patogener, mange andre |
| fotoheterotroph | Lys | Organiske forbindelser | Nogle lilla bakterier |
Det er vigtigt at bemærke, at dette er en forenklet oversigt, og der er mange variationer og overlapninger inden for disse kategorier.