Hvordan folder cellemaskiner fejlfoldede proteiner ud?

Proteinkæder foldes typisk for at fungere. Foldning er en kompleks proces, og hvis det gøres korrekt, fører det til en unik funktionel foldetopologi for en given proteinkæde. Andre topologier er også mulige, men er ofte ikke-funktionelle eller giftige. Disse fejlfoldede proteiner foldes derefter ud og foldes derefter tilbage til den korrekte foldtopologi; Ellers, de undergår nedbrydning.

Flere maskiner, herunder ClpB og ClpG, er ansvarlige for udfoldning af et foldet protein. ClpB arbejder tæt sammen med HSP70 (DnaK) og HSP40 (DnaJ) og bruger energi til at udfolde en kæde, mens ClpG ikke er afhængig af HSP70. Et stort spørgsmål er, hvorfor celler er udstyret med forskellige typer maskiner, og hvad der bestemmer effektiviteten af ​​udfoldelse. Alireza Mashaghi og hans team ved LACDR/Leiden University løste dette puslespil ved at overvåge udfoldelse af fejlfoldede kædemodeller på enkeltmolekylniveau. Tre udfoldelsesmetoder blev sammenlignet, nemlig, tråd gennem en pore, trækker fra enderne, og trækker ved trådning.

Resultaterne af denne analyse, som udgives den 25. oktober i Journal of Physical Chemistry B , afsløre, at kredsløbstopologi i den foldede kæde kritisk bestemmer antallet af veje og effektiviteten af ​​udfoldelse på en måde, der afhænger af den anvendte mekaniske tilgang. Undersøgelsen giver indsigt i mekanismer til udfoldelse af cellulære proteiner. Disse fund kan hjælpe med at vælge optimale chaperon -mål for farmakoterapi ved fejlfoldede sygdomme.