Molekylet PO4 3− har fire oxygenatomer, der omgiver et centralt fosforatom, med en negativ ladning på 3. Ilts elektronegativitet er 3,44, mens fosfor er 2,19. Denne forskel i elektronegativitet får elektronerne til at deles ulige, hvilket resulterer i polære bindinger mellem fosfor- og oxygenatomerne. Molekylets geometri er tetraedrisk, med de fire oxygenatomer arrangeret i hjørnerne af et tetraeder. Fosforatomet er placeret i midten af tetraederet. De polære bindinger mellem phosphor- og oxygenatomerne skaber en netto negativ ladning på molekylet, hvilket gør det polært.