HCl bruges til at opløse ciprofloxacinpulver, fordi det sænker opløsningens pH og derved øger lægemidlets opløselighed. HCl'et reagerer med vandet og danner hydroniumioner (H3O+), som derefter protonerer amingruppen i ciprofloxacin. Dette resulterer i dannelsen af ciprofloxacinhydrochlorid, som er mere opløseligt i vand end lægemidlets frie baseform.
Mængden af HCl, der kræves for at opløse ciprofloxacinpulver, vil afhænge af den ønskede koncentration af lægemiddelopløsningen. For at fremstille en 10 mg/ml opløsning af ciprofloxacin kræves der f.eks. ca. 1,5 ml 1 N HCl pr. gram ciprofloxacinpulver.