1. Hydrofobe interaktioner:
* Proteiner er typisk opløselige i vand på grund af deres hydrofile (vandelskende) grupper, der danner brintbindinger med vandmolekyler.
* De indeholder imidlertid også hydrofobe (vandfrydende) grupper, der har tendens til at klynge sig sammen.
2. Ammoniumsulfats indflydelse:
* Når ammoniumsulfat tilsættes til en proteinopløsning, interagerer det med vandmolekylerne, hvilket effektivt fjerner dem væk fra proteinets hydrofile grupper.
* Denne forstyrrelse af hydratiseringsskaller omkring proteinet udsætter de hydrofobe grupper.
3. Aggregering og nedbør:
* Når koncentrationen af ammoniumsulfat øges, bliver de hydrofobe grupper på forskellige proteinmolekyler mere eksponeret og interagerer med hinanden, hvilket fører til aggregering.
* Til sidst bliver disse aggregater store nok til at blive uopløselige og udfælder ud af opløsningen.
Faktorer, der påvirker nedbør:
* Proteinkoncentration: Højere proteinkoncentrationer kræver højere ammoniumsulfatkoncentrationer til nedbør.
* Proteintype: Forskellige proteiner har forskellige grader af hydrofobicitet, hvilket fører til forskellige følsomheder over for ammoniumsulfatudfældning.
* ph: Opløsningens pH -værdi kan påvirke ladningen af proteinet og dets interaktion med ammoniumsulfat.
* Temperatur: Højere temperaturer forbedrer generelt proteinopløselighed, hvilket kræver højere ammoniumsulfatkoncentrationer til nedbør.
Anvendelser af ammoniumsulfatudfældning:
* Proteinoprensning: Det er en almindelig teknik til at koncentrere og delvis rense proteiner fra komplekse blandinger.
* Krystallisation: Ammoniumsulfat kan bruges til at fremme proteinkrystallisation, som er afgørende for strukturelle studier.
Fordele ved anvendelse af ammoniumsulfat:
* Relativt billig og let tilgængelig.
* Generelt ikke-denaturerende for proteiner, hvilket betyder, at det ikke ødelægger deres oprindelige struktur.
* Tillader selektiv nedbør baseret på proteinegenskaber.
Overvejelser:
* Det er vigtigt at optimere ammoniumsulfatkoncentrationen for hvert specifikt protein og det ønskede resultat.
* Bundfaldet kan indeholde andre molekyler udover målproteinet, hvilket kræver yderligere oprensningstrin.
* Nogle proteiner kan være følsomme over for høje saltkoncentrationer.
Afslutningsvis er ammoniumsulfatudfældning en værdifuld teknik til at adskille og rense proteiner ved at udnytte forskellene i deres hydrofobe interaktioner og opløselighed i nærvær af høje saltkoncentrationer.