Sådan beregnes Audpc

Området under sygdomsfremgangskurven (AUDPC) er et kvantitativt mål for sygdomsintensitet med tiden. Det bruges i plantepatologi til at indikere og sammenligne niveauer af resistens mod sygdomme blandt plantetyper. Den trapesformede metode. Den mest almindelige måde at beregne AUDPC på. Det udføres ved at anvende en formel udformet af Campbell og Madden i 1990 eller ved at tegne en graf af procentdelen af ​​infektion mod tiden og opsummering af trapezoiderne mellem tidsintervaller.

Måle sygdomsprogression

Forskningsregler og retningslinjer, der gælder for måling af den specifikke sygdom og afgrøde, du undersøger. Den krævede størrelse af planteprøven varierer efter afgrøde og sygdom. For eksempel kræver en minimumsprøve på 40 planter at studere sent rødme i knolde.

Plant det rette antal planter, der kræves til undersøgelsen.

Se omhyggeligt på tegn på sygdommen. Forskning, når tegn forventes at ske, så du er forberedt. For eksempel forekommer tegn på sen rødme omkring 30 til 40 dage efter plantning og 10 dage efter den sidste anvendelse af fungicid.

Estimér visuelt procentdelen af ​​inficeret bladareal i din prøve, så snart du bemærker sygdommen.

Optag procentdelen af ​​inficeret bladområde med regelmæssige tidsintervaller. Forskere læser for sent blight hver syv dage, hvis sygdommen skrider hurtigere frem end forventet. Aflæsninger foretages hver 14. dag, hvor sygdomsprogressionen er langsommere.

Stop med at registrere infektionsmålinger, når procentdelen af ​​infektionen holder op med at øge, og sygdomsprogressionsniveauerne.

Beregn AUDPC fra en ligning

Tilføj de to første infektionsprocenter, du har optaget.

Del tilsætningsresultatet med to for at finde gennemsnittet eller middelværdien af ​​de to aflæsninger.

Multiplicér gennemsnitsværdien eller middelværdien af tidsintervallet, hvilket er antallet af dage fra førstebehandlingen til andenbehandlingen. Hvis du først tog førstebehandlingen på dag 20 og andenbehandlingen på dag 27, så er antallet af dage eller tidsintervallet syv dage.

Optag resultatet i enheder af procentvise dage. Værdien er et område af en trapezoid.

Gentag trinene 1 til 4 for den anden og tredje infektionslæsning du tog. Deres resultat vil være området for en anden trapezoid. Gentag trin ét til fire, indtil du har beregnet trapezoide områder til alle aflæsninger.

Tilføj alle trapezoiderne for at finde AUDPC. Nedre AUDPC'er repræsenterer langsommere sygdomsprogression og større modstand mod sygdommen. Højere AUDPC'er repræsenterer hurtigere sygdomsfremgang og højere modtagelighed for sygdommen.

Tip

AUDPC findes også ved at plotte procentdelen af ​​infektion mod tiden på en graf. Området for hver trapezium mellem aflæsningerne beregnes ved hjælp af simpel geometri.

AUDPC giver mulighed for tidsintervaller mellem aflæsninger at variere, men aflæsninger skal starte kort efter sygdommen begynder. En lang forsinkelse resulterer i modtagelige materialer, der ikke indgår i sygdomsprogresskurven.

Advarsel

På grund af den vurdering, der er involveret i vurderingen af ​​procentdelen af ​​infektion, betragtes AUDPC som en pseudokvantitativ variabel. AUDPC er kun et skøn over området under den faktiske infektionskurve.

AUDPC'en er generelt ikke sammenlignelig på tværs af eksperimenter på grund af forskellige faktorer som tilstedeværelsen af ​​ugunstige eller gunstige sygdomsforhold.