Forskere har dokumenteret omfattende mangfoldighed i de mikrobielle samfund, der lever i de ekstremt varme, dybhavssedimenter placeret i Guaymas-bassinet i Californienbugten. Denne udsigt over Guaymas Basin -havbunden blev taget gennem vinduet på Alvin -nedsænkningen af Brett Baker i november 2018. Kredit:Brett Baker/University of Texas i Austin.
Forskere ved University of Texas ved Austins Marine Science Institute har opdaget næsten to dusin nye typer mikrober, mange af dem bruger kulbrinter som metan og butan som energikilder til at overleve og vokse - hvilket betyder, at de nyligt identificerede bakterier kan være med til at begrænse koncentrationerne af drivhusgasser i atmosfæren og måske en dag være nyttige til at rydde op i olieudslip.
I et papir udgivet i Naturkommunikation denne uge, forskere dokumenterede omfattende mangfoldighed i de mikrobielle samfund, der lever i det ekstremt varme, dybhavssedimenter placeret i Guaymas-bassinet i Californienbugten. Teamet afdækkede nye mikrobielle arter, der er så genetisk forskellige fra dem, der tidligere er blevet undersøgt, at de repræsenterer nye grene i livets træ. Mange af de samme arter besidder stærke forurenende ædeevner, ligesom andre, tidligere identificerede mikrober i havet og jorden.
"Dette viser, at de dybe oceaner indeholder ekspansiv uudforsket biodiversitet, og mikroskopiske organismer, der er i stand til at nedbryde olie og andre skadelige kemikalier, "sagde adjunkt i havvidenskab Brett Baker, papirets primære efterforsker. "Under havbunden enorme reservoirer af kulbrintgasser - herunder metan, propan, butan og andre - eksisterer nu, og disse mikrober forhindrer, at drivhusgasser frigives til atmosfæren. "
Den nye undersøgelse, repræsenterer den største genomiske prøveudtagning af sedimenter fra Guaymas Basin nogensinde, blev medforfatter af den tidligere UT-postdoktorforsker Nina Dombrowski og professor Andreas P. Teske ved University of North Carolina.
Brett Baker (venstre) og piloten Jefferson Grau inde i dybhavet nedsænket Alvin under et dyk i Guaymas-bassinet i november 2018. Kredit:Andreas Teske
Forskernes analyse af sediment fra 2, 000 meter under overfladen, hvor vulkansk aktivitet øger temperaturen til omkring 200 grader Celsius, genvundet 551 genomer, 22 heraf repræsenterede nye poster i livets træ. Ifølge Baker, disse nye arter var genetisk forskellige nok til at repræsentere nye grene i livets træ, og nogle var forskellige nok til at repræsentere helt nye phyla.
"Livets træ er noget, som folk har forsøgt at forstå, siden Darwin kom med konceptet for over 150 år siden, og det er stadig dette bevægelige mål i øjeblikket, "sagde Baker, som tidligere var en del af et team, der kortlagde det hidtil mest omfattende genomiske træ. "At prøve at kortlægge træet er virkelig vigtigt for at forstå alle aspekter af biologi. Med DNA -sekventering og de computertilgange, vi bruger, vi kommer tættere på, og tingene udvider sig hurtigt. "
Kun omkring 0,1 procent af verdens mikrober kan dyrkes, hvilket betyder, at der er tusinder, måske endda millioner, af mikrober, der endnu ikke er opdaget.
Baker's team undersøger interaktioner mellem mikrobielle samfund og de næringsstoffer, der er tilgængelige for dem i miljøet ved at tage prøver af sediment og mikrober i naturen, og derefter ekstrahering af DNA fra prøverne. Forskerne sekventerer DNA'et for at sammensætte individuelle genomer, sæt af gener i hver organisme, og udlede af dataene, hvordan mikrober forbruger forskellige næringsstoffer.
Alvin dybhavs nedsænket venter på endnu en indsamling i Guaymas-bassinet i november 2018. Kredit:Brett Baker/University of Texas i Austin
"For det, vi forsøger at lede efter organismer, der er blevet undersøgt før, og lede efter ligheder og forskelle, "sagde Dombrowski, som nu er på Royal Netherlands Institute for Sea Research. "Det lyder måske let i starten, men er det virkelig ikke, da ofte mere end halvdelen af de gener, vi finder, er hidtil ukarakteriserede og ukendte. "
Prøverne blev indsamlet ved hjælp af Alvin nedsænkbare, den samme sub, der fandt Titanic, fordi mikroberne lever i ekstreme miljøer. Teske, der samarbejdede med Baker og Dombrowski, har drevet prøvetagning i Guaymas Basin i flere år, arbejder med forskere over hele verden, der bruger forskellige tilgange til at studere livet der.
Denne måned, Baker er en del af et team på Alvin -prøveudtagningen i områder af bassinet, der aldrig har været undersøgt.
"Vi tror, at dette nok kun er toppen af isbjerget med hensyn til mangfoldighed i Guaymas -bassinet, "Sagde Baker." Så, vi laver meget mere DNA -sekventering for at prøve at få styr på, hvor meget mere der er. Dette papir er egentlig bare vores første tip om, hvad disse ting er, og hvad de laver. "