Forskere frigiver verdens første DNA-kort over en truet australsk mus, og det vil hjælpe med at redde det

Den indfødte australske gnaver Pseudomys fumeus, kaldet røgmus for sin farve, kæmpede allerede mod udryddelse, da bushbrandsæsonen 2019-20 ramte.

Den sorte sommer-bushbrande, der satte ild til mere end 24 millioner hektar, kan have dræbt en anslået 1 milliard dyr og sat mere end 100 truede arter i fare. Brandene ødelagde også mere end 90 % af den røgfyldte muses habitat, og ni mus døde endda på et avlsanlæg i fangenskab nær Canberra som følge af indånding af bushbrandrøg.

Men alt er ikke tabt – et nyligt sekventeret referencegenom vil nu hjælpe den igangværende bevaringsindsats af denne hjemmehørende australske art.

Ædle lommer med mus

Vi har ikke set vilde, røgfyldte mus i Australian Capital Territory siden 1987. I Victoria findes arten kun i Grampians, Central Highlands og alpine regioner, og i New South Wales i de alpine regioner i Kosciuszko National Park og sydøstlige skove. nær Nullica.

En aktiv genopretningsplan blev etableret for musen i 2006. Som en del af dette startede naturbeskyttelsesfolk to populationer i fangenskab, hvor udsætninger fandt sted i sydøstlige skove nær Nullica og et rovdyrsikkert reservat i ACT.

Disse små indfødte mus er mere end søde, omtrent dobbelt så store som den introducerede husmus (Mus musculus). Deres kulpels er blød og silkeagtig, og de dufter også rigtig dejligt. Hannerne lugter især ligesom røget brændt vanilje; disse dyr har et dejligt, roligt temperament.

I de sidste 12 måneder har et Museums Victoria Research Institute-team været i gang med undersøgelser for at søge efter overlevende lommer af den truede musepopulation med henblik på fremtidig genindførelse af mus i fangenskab.

For at støtte disse igangværende bevaringsbestræbelser gik DNA Zoo ved University of Western Australia sammen med Museums Victoria Senior Curator of Pattedyr Kevin Rowe for at sekventere et verdensførste referencegenom i fuld kromosomlængde til dyret.

Beskyttelse af det, vi har

Vi kan nu bruge dette referencegenom til at informere om bevaringsstrategi. Forskere vil kortlægge 70 individuelle DNA-sekvenser fra røgfyldte mus fra hele dyrets habitatområde – i Grampians i det vestlige Victoria til sydøstlige New South Whales.

At øge vores forståelse af levende dyreliv og ansvarlig forvaltning af tilgængelige ressourcer er blandt de mest afgørende videnskabelige og sociale udfordringer, vi står over for i dag.

På trods af store teknologiske fremskridt er der meget, vi ikke ved om Australiens indfødte biodiversitet. Samtidig er det i stigende grad truet af naturbrande, klimaændringer, ødelæggelse af levesteder, artsudnyttelse og andre menneskerelaterede aktiviteter.

Heldigvis kan vi bruge genomik til at hjælpe med at formulere en informeret bevaringsstrategi. Det skyldes, at prøvetagning af genomisk diversitet kan give os en grundlæggende forståelse af, hvor godt arten klarer sig (hvad biologer kalder "populationsfitness"). Med den viden i hånden kan vi bedre designe konserveringsprogrammer.

For eksempel kan vi i truede arter med stærkt reducerede populationer undgå indavl, hvis vi bruger genomiske data til at hjælpe med at designe avlsprogrammer. På den måde vil dyrene have færre gener, der fører til for tidlig død, og have øget sygdomsresistens.

Konsultation af de genetiske tegninger

At opnå de genetiske tegninger for australsk dyreliv vil skabe en stærk kilde til opdagelse til at forbedre og øge økosystemtjenesterne. En veldesignet overvågningsramme er afgørende for bevaringsprogrammernes succes på jorden.

Som en del af genopretningsplanen for den røgfyldte mus har vi DNA-sekvenser fra individer i Grampians, såvel som historiske prøver, der går tilbage til 1934 fra uddøde populationer i Otways og Fjernøsten Gippsland.

Grampians prøverne er af særlig interesse. Det skyldes, at denne befolkning er den mest isolerede, fjernet ca. 350 kilometer fra den nærmeste kendte befolkning i Yarra-området i det centrale højland.

Siden 2012 har Museums Victoria og partnere fanget, mærket og indsamlet prøver – ørebiopsier og afføringpiller, som ingen af ​​dem er skadelige for dyrene – fra mere end 200 røgfyldte mus i Grampians. Takket være dette arbejde har vi nu den mest talrige og kontinuerlige registrering af arten i Victoria.

Derudover har fangst og dyrelivskameraundersøgelser på mere end 100 steder afsløret røgfyldte musepopulationer lokaliseret til to områder mindre end 10 km fra henholdsvis Victoria Range og Mt William Range.

Forskere vil nu lede efter genetiske spor om, hvordan disse dyr fortsatte på trods af tørke, invasive rovdyr og betydelig brand.

Det, der er opmuntrende, er, hvordan kraftfuld teknologi – såsom genomsekventering, bioinformatik og mere kombineret sammen – nu hjælper os med at forstå og bevare biodiversiteten. For første gang i historien kan vi hurtigt spore og effektivt sekventere genomerne fra vores unikke hjemmehørende australske art. + Udforsk yderligere

Død af ironi:Mysteriet om musen, der døde af røginhalering, men som ikke kom i nærheden af ​​en brand

Denne artikel er genudgivet fra The Conversation under en Creative Commons-licens. Læs den originale artikel.