De to strenge af DNA-molekylet er antiparallelle, hvilket betyder, at de løber i modsatte retninger. Dette er vigtigt for DNA'ets struktur og funktion, da det tillader de to strenge at danne brintbindinger med hinanden, som holder molekylet sammen. Den antiparallelle orientering af strengene tillader også, at DNA'et kan replikeres, da hver streng kan tjene som skabelon for syntesen af en ny streng.