1. Pigmenter:
* chlorophyta (grønne alger): Besidder chlorophyll A og B, hvilket giver dem en grøn farve.
* phaeophyta (brune alger): Indeholder chlorophyll A og C såvel som carotenoider, hvilket giver dem en brun farve.
* rhodophyta (røde alger): Har chlorophyll A og phycobiliner, der absorberer blåt og grønt lys, hvilket får dem til at virke røde.
2. Opbevaringsprodukter:
* grønne alger: Opbevar mad som stivelse.
* brune alger: Opbevar mad som laminarin og mannitol.
* røde alger: Opbevar mad som Floridean stivelse.
3. Cellevægsammensætning:
* grønne alger: Har cellevægge lavet af cellulose.
* brune alger: Cellevægge indeholder algin, cellulose og fucoxanthin.
* røde alger: Cellevægge har en blanding af cellulose, agar og carrageenan.
4. Flagella:
* grønne alger: Nogle har flagella, andre gør det ikke.
* brune alger: Har normalt flagellerede reproduktionsceller.
* røde alger: Flagella er fraværende i de fleste.
5. Reproduktion:
* grønne alger: Gengive både seksuelt og aseksuelt.
* brune alger: Har komplekse livscyklusser med både seksuelle og aseksuelle faser.
* røde alger: Regener primært seksuelt med nogle arter, der udviser aseksuel reproduktion.
6. Morfologi:
* grønne alger: Kan være encellulær, kolonial, filamentøs eller multicellulær.
* brune alger: Mest multicellulær, med nogle nåede kæmpe størrelser (f.eks. Kelp).
* røde alger: Primært multicellulær, der ofte optræder som delikate, forgrenede filamenter eller ark.
7. Habitat:
* grønne alger: Fundet i en lang række levesteder, herunder ferskvand, saltvand og endda på land.
* brune alger: Primært marine, der ofte findes i kolde, næringsrige farvande.
* røde alger: Oftest marine, men nogle kan trives i ferskvand og endda på land.
Det er vigtigt at bemærke, at dette kun er nogle af de vigtigste egenskaber, der bruges til klassificering af plantelignende protister. Der er mange andre faktorer, der kan bruges til at skelne mellem forskellige grupper af alger. Klassificeringssystemet udvikler sig konstant, når nye opdagelser foretages, og der opnås ny indsigt.