1. mejeriprodukter: Enzymer som Rennet (fra dyre mave) eller mikrobiel rennet bruges til ostefremstilling til curdeltmælk, der adskiller de faste stoffer (ostemasse) fra væsken (valle).
2. Brødfremstilling: Amylaser tilsættes til mel for at nedbryde stivelse i sukker, hvilket resulterer i en blødere, lettere fordøjeligt brød.
3. frugtsaft: Pektinaser bruges til at afklare frugtsaft ved at nedbryde pectin, hvilket kan forårsage uklarhed.
Der er mange andre steder, hvor enzymer bruges i fødevareproduktion, men disse tre er nogle af de mest almindelige eksempler.