Raman og infrarød spektroskopi hjælper med at identificere forskellige acetylerede lysiner

Et forskerhold ledet af prof. Huang Qing fra Hefei Institutes of Physical Science (HFIPS) under det kinesiske videnskabsakademi har brugt infrarød og Raman-spektroskopi til at identificere lysin-acetyleringsfunktioner, hvilket giver et teoretisk og eksperimentelt grundlag for analysen af ​​proteinacetyleringsstrukturer i biologiske systemer.

Deres resultater blev offentliggjort i Spectrochimica Acta Part A:Molecular and Biomolecular Spectroscopy .

Acetylering er en almindelig og vigtig proteinmodifikation i biologien og spiller en central regulerende rolle i cellulær metabolisme. Der er to måder at proteinacetylering på, den ene er Nε-acetylering specifik for lysinrester, og den anden er N-terminal acetylering, der kan forekomme på forskellige aminosyrerester.

På nuværende tidspunkt bruges N-terminal acetyltransferase generelt til at mærke for at bestemme, om lysinrester er acetyleret, men nøjagtigheden af ​​denne metode er stadig kontroversiel. Identifikation af proteinacetylering på molekylært niveau er en af ​​de aktuelle forskningsudfordringer, og nøglen er nøjagtigt at lokalisere og karakterisere acetyleringen af ​​lysin for at opnå en klar og systematisk forståelse.

For at løse dette problem undersøgte forskerholdet systematisk de strukturelle ændringer og tilsvarende vibrationsspektrale karakteristika af de tre acetyleringstyper (Nε-Ace-Lys, Na-Ace-Lys og NαNε-Ace-Lys) af L-lysin gennem infrarød og Raman spektroskopi-eksperimenter og tæthedsfunktionsteoretiske beregninger. De fandt ud af, at de infrarøde og Raman-karakteristiske bånd af amidgruppe, carboxylgruppe og andre grupper kan bruges til effektivt at identificere forskellige acetyleringstyper.

Med andre ord, om lysin var acetyleret, kan afgøres ud fra karakteristikaene for infrarøde og Raman-spektre, såvel som typen af ​​lysin.

Samtidig blev holdets vibrationsspektroskopi-identifikationsstrategi for acetylering også verificeret i peptidmodellen.

Denne forskning tilvejebringer vibrationstilstandsanalysen af ​​acetyleret lysin og foreslår en spektral identifikation og en ny karakteriseringsmetode til lysinacetylering. + Udforsk yderligere

Forskere identificerer nøgleprotein i en mekanisme, der styrer proteiners levetid