Ny grundlæggende indsigt i kampen mod bakterier

Tarmbakterien E. coli kan tilpasse sig ændringer i omgivelserne. Leiden-forskere har opdaget, hvordan H-NS-proteinet gør dette muligt. Denne nye viden kan være et vigtigt udgangspunkt i bekæmpelsen af ​​bakterier og sygdomme som bughindebetændelse. Offentliggørelse 2. oktober i tidsskriftet eLife.

E.coli er ansvarlig for alle slags sygdomme, inklusive bughindebetændelse, og er også en af ​​årsagerne til madforgiftning. Denne bakterie indeholder proteinet H-NS, som kan tænde og slukke for bakteriens gener. Ved at tænde og slukke for disse gener kan bakterien overleve ændringer i omgivelserne, såsom stigning eller fald i temperaturen. Ramon van der Valk fra Leiden Institute of Chemistry har opdaget, hvordan netop denne proces fungerer. Denne viden kan være grundlaget for at udvikle nye antibiotika til bekæmpelse af E. coli-bakterien (og andre).

H-NS registrerer selv ændringer i miljøet

Så længe siden som i 2000, min kollega Remus Dame opdagede, hvordan H-NS-proteinet slukker for bestemte gener i E. coli-bakterien, ' forklarede Van der Valk. 'Men vi vidste ikke, hvordan disse gener kan tændes igen. Det ser nu ud til, at H-NS modtager signaler fra omgivelserne, hvis der sker en ændring i bakteriens omgivelser, og som en reaktion på dette tænder generne igen.' Takket være arbejdet fra Van der Valk og hans kolleger, denne proces er nu kortlagt. H-NS selv ser ud til at være i stand til at opdage ændringer, herunder ændringer i temperatur og natriumindhold.

Undersøgelsen var et partnerskab mellem universiteterne i Leiden, Amsterdam, og Heidelberg (D), hvor forskerne anvendte en multidisciplinær tilgang til at undersøge, hvordan H-NS virker og dets effekt på miljøet. 'Undersøgelsen fokuserede på forskellige signaler fra miljøet, som proteinet reagerede på, såsom temperatur, pH eller ændringer i saltkoncentrationen. Ved at bruge biokemiske og biofysiske metoder i kombination med computersimuleringer, vi var i stand til at analysere effekten af ​​disse symboler på H-NS. I et reagensglas, vi var så i stand til at påvirke den måde, N-NS binder til DNA.'

Resultaterne af Van der Valk og hans kolleger er blevet offentliggjort i tidsskriftet eLife .