Videnskab
 science >> Videnskab >  >> Biologi

Genetikere opdager nye vilde gedearter via gammelt DNA

Udvidet D-beregning og anvendelse til Direkli4-specifik alleldeling. (A) Udvidet D-statistik. For at kontrollere for genflow med Capra-slægten betinger vi varianter afledt i Direkli4 (H3) og et genom X (H2), men forfædre i andre populationer (her:Får, ikke-bezoar Capra-genomer, bezoar fra Direkli-hulen og anden bezoar). Værdier er beregnet i forhold til et sæt neolitiske geder fra Zagros-bjergene og normaliseret på samme måde som D-statistikken. (B) Udvidede D-statistiske værdier for Direkli4 ved hjælp af transversioner, (C) plottet gennem tiden. Hvert symbol er et testgenom med form, der angiver tidsperiode. Sorte kanter angiver en |Z| score ≥3 ved brug af 1000 bootstrap-replikater og 5 Mb blokke. Kredit:eLife (2022). DOI:10.7554/eLife.82984

Genetikere fra Trinity College Dublin har sammen med et team af internationale samarbejdspartnere opdaget en hidtil ukendt slægt af vilde geder over ti årtusinder gamle. Forskningen er netop blevet offentliggjort i tidsskriftet eLife .

Den nye gedetype, opdaget fra genetisk screening af knoglerester og omtalt som "den Taurasiske tur", overlevede sandsynligvis Last Glacial Maximum (istiden), som strandede deres forfædre i de høje toppe af Taurusbjergene i Tyrkiet, hvor deres der blev fundet rester.

En tilfældig opdagelse ved Direkli-grotten

For over 12.000 år siden var jæger-samlere i Taurusbjergene i det sydlige Tyrkiet stærkt afhængige af lokalt vildt til mad og underhold. Beliggende nær den nuværende landsby Döngel og i en højde af ~1.100 m over havets overflade, blev Direkli-hulen brugt i omkring tre årtusinder (~14.000-11.000 år siden) som en sæsonbestemt lejr for disse jægere og kan have været beboet år. -rund.

"Blandt artefakter fundet ved Direkli Cave var store mængder knoglerester med tydelige forarbejdningsmærker, hvilket indikerer, at vilde geder blev slagtet der til forbrug," siger Dr. Kevin Daly, fra Trinity's School of Genetics and Microbiology, som er førsteforfatter af forskningsartikel.

"Med hulen omgivet af høje toppe, der når ~2.200 m, var den vilde ged eller bezoar ibex (Capra aegagrus), der bor i regionen i dag, sandsynligvis målet for disse sen-pleistocæn-jægere."

Under genetisk screening af gedeknoglerester fra Direkli bemærkede genetikerne noget usædvanligt:​​mange af gederne bar mitokondrielle genomer, der ligner en anden art af vilde geder.

Mens tamgeden stammer fra bezoar-bukken, er andre arter af vilde geder stadig i live i dag og findes i relativt begrænsede områder. Disse omfatter Øst- og Vestkaukasus tur, to søsterarter (eller underarter) af vilde geder, der nu kun findes i Kaukasusbjergene i Georgien. Mange af prøverne fra Direkli Cave bar mitokondrier relateret til disse Caucasus tur, på trods af at Direkli Cave er omkring 800 km fra deres nuværende habitat.

Dr. Daly tilføjer, at "en endnu større overraskelse kom, da vi undersøgte Direkli Cave gedernes nukleare genomer:mens de fleste lignede bezoar ibex, som forventet, så en prøve anderledes ud end resten. Denne prøve, Direkli4, viste mere forfædres genetiske varianter end andre Direkli-geder, hvilket indikerer, at det kunne have været en anden art end de andre."

For bedre at forstå dette samarbejdede Trinity-teamet med forskere fra Muséum national d'Histoire naturelle i Paris for at generere genetiske data fra andre arter i Capra-gruppen.

En ny slægt af Tur

Holdet var overrasket over at se, at Direkli4-prøven faktisk grupperede sig med den kaukasiske tur - tilsyneladende at være en søstergruppe til både øst- og vesttyper. Holdet undersøgte mere materiale fra Direkli-hulen og fandt yderligere to prøver med et "tur-lignende" genom, hvilket tyder på, at en population af disse tur-slægtninge boede i Taurusbjergene tæt på den lokale bezoar ibex, hvor begge blev jaget af mennesker i forhistorisk tid.

Holdet foreslår et navn for den opdagede Taurasiske tur:Capra taurensis eller Capra caucasica taurensis; forskere klassificerer stadig levende tur som enten underarter eller to forskellige arter.

Da tur er større og tungere end andre vilde geder, med en karakteristisk hornform, burde det være muligt at identificere en gruppe tur-slægtninge i dyrerester. Hornrester er fraværende ved Direkli-hulen, på trods af det store antal rester - hvilket muligvis peger på, at disse er en værdifuld præmie blandt jægere. Men arkæozoologer i holdet viste, at der var mange geder med stor krop ved Direkli Cave - og muligvis andre bjergrige steder i det sydvestlige Asien.

"Vi håber, at dette vil tilskynde til re-evaluering og analyse af faunarester i regionen, da der stadig kan være nogle spændende opdagelser at finde," tilføjede Dr. Daly.

Et offer for klimaændringer og menneskelig aktivitet?

Holdet foreslår, at forfædrene til tur levede over et bredere geografisk område i løbet af de sidste 100.000 år, fra Kaukasusbjergene til Taurusbjergene ved Middelhavet - og at klimaændringer kan have forårsaget habitatfragmentering.

Dr. Daly siger, at "det sidste istidsmaksimum, eller istiden, kan have gjort mange områder ugæstfrie, hvilket har tvunget disse geder til at konkurrere med andre arter. Taurasian tur kan have været en restgruppe, begrænset til toppene i Taurusbjergene. Øget menneskelig aktivitet ville have lagt yderligere pres på Taurasian tur, med jagt påvist ved Direkli Cave."

"Selvom vi ikke ved præcis, hvornår eller hvordan denne gedeafstamning uddøde, kan yderligere genomiske undersøgelser i regionen vise, at deres genomer lever videre i nutidens vilde geder." + Udforsk yderligere

10.000 år gammelt DNA skriver de første fortællinger om de tidligste tamme geder




Varme artikler