Omfattende gennemgang af de væsentlige roller og reguleringsmekanismer af lncRNA'er i frugt og grøntsager

Med udviklingen af ​​genomsekventeringsteknologier er mange lange ikke-kodende RNA'er (lncRNA'er) blevet identificeret i frugt og grøntsager. Omfattende forskning i lncRNA'er har afsløret deres roller i reguleringen af ​​ekspressionen af ​​proteinkodende gener på både transkriptionelle og post-transkriptionelle niveauer og spiller derved en afgørende rolle i vækst, udvikling og stressresponser i frugt og grøntsager.

En ny anmeldelse offentliggjort i Hortikulturforskning giver et omfattende resumé af den nuværende forståelse af dannelsen, funktionelle karakteristika og regulatoriske mekanismer af lncRNA'er i frugt og grøntsager.

Baseret på deres transkriptionsretning og position i forhold til proteinkodende gener, klassificeres lncRNA'er i fire typer:intergene lncRNA'er (lincRNA'er), lange ikke-kodende antisense-transkripter (lncNAT'er), sense-lncRNA'er og introniske lncRNA'er (incRNA'er). I dette papir beskrives dannelsen og de grundlæggende egenskaber af lncRNA'er i frugt og grøntsager ud fra tre aspekter:overflod og størrelse, struktur og lokalisering, henfald og evolution.

Rollerne af lncRNA'er i frugt og grøntsager er blevet omfattende opsummeret og diskuteret i nyere forskningsrapporter, der dækker forskellige aspekter, herunder pigmentophobning, udvikling af reproduktive organer, frugtmodning, samt reaktioner på næringsstofmangel, salt, tørke, temperatur og patogene bakterier .

Derudover har forfatterne belyst de regulatoriske mekanismer af lncRNA'er i gentranskriptionel regulering og alternativ splejsning, såvel som interaktionerne mellem lncRNA'er og plantehormoner, transkriptionsfaktorer og miRNA'er.

Udviklingen af ​​high-throughput sekventeringsteknologi har i høj grad forbedret evnen til at opdage, forudsige og identificere lncRNA'er. Der er dog stadig en mangel på omfattende lncRNA-analysedata i plantedatabaser vedrørende lncRNA'er i frugt og grøntsager, hvilket hindrer karakteriseringen af ​​lncRNA-ekspression og lokalisering.

Desuden udgør omkostningerne forbundet med subcellulære lokaliseringseksperimenter af lncRNA'er, såsom FISH, en begrænsning for lncRNA-undersøgelser, hvilket understreger det presserende behov for udvikling af mere overkommelige metoder til lncRNA's forskning.

Udforskningen af ​​lncRNAs funktion og mekanisme i frugt- og grøntsagsafgrøder er stadig i sin tidlige fase, og den hurtige udvikling af teknologi vil bringe nye muligheder og gennembrud for lncRNA-forskning i frugt og grøntsager.

Flere oplysninger: Xiuming Zhao et al., Nye roller og mekanismer af lncRNA'er i frugt og grøntsager, Harticulture Research (2024). DOI:10.1093/time/uhae046

Journaloplysninger: Gavebrugsforskning

Leveret af Chinese Academy of Sciences