Ny teknologi ændrer, hvordan proteiner i individuelle celler studeres

Forskere fra Karolinska Institutet har sammen med Pixelgen Technologies udviklet og anvendt en teknik, der gør det muligt at kortlægge proteiner i individuelle celler på en helt ny måde. Ikke kun er det nu muligt at måle mængden af ​​proteiner, men også hvordan de er fordelt i cellens membran og hvordan de interagerer med hinanden.

Tidligere kunne forskere kun studere et begrænset antal proteiner i individuelle celler ved hjælp af såkaldt flowcytometri. Men den nye teknik, kaldet molekylær pixelering, går et skridt videre. Det er nu muligt at analysere hundredvis af proteiner samtidigt og få et mere detaljeret billede af deres fordeling og interaktioner i individuelle celler. Dette er vigtigt, fordi proteiner spiller en afgørende rolle i cellulær funktion og signalering.

Resultaterne er publiceret i tidsskriftet Nature Methods .

"Ved at forstå, hvordan proteiner opfører sig i individuelle celler, kan vi bedre studere sygdomme som kræft og inflammatoriske lidelser. Derudover kan vi bruge teknikken til at evaluere nye lægemidler og deres indvirkning på fordelingen af ​​proteiner i cellerne," siger en af ​​de to læger. forfatterne af undersøgelsen, Petter Brodin, professor ved Institut for Kvinders og Børns Sundhed, Karolinska Institutet.

"Ingen andre har tidligere rapporteret om en lignende teknologi, og derfor er dette så unikt," siger Brodin.

Næste skridt er at bruge molekylær pixelering i forskning i kræft, immunsystemet og andre processer, hvor proteinfordelingen ændrer sig over tid, ifølge Petter Brodin.

"Dette er spændende, fordi det vil åbne helt nye muligheder inden for enkeltcelleanalyse og bidrage til vores forståelse af biologiske processer," siger Brodin.

Flere oplysninger: Filip Karlsson et al., Molecular pixelation:spatial proteomics of single cells by sequencing, Nature Methods (2024). DOI:10.1038/s41592-024-02268-9

Journaloplysninger: Naturmetoder

Leveret af Karolinska Institutet