* Tidlig profase ligner meget interfase: Atomkonvolutten er stadig intakt, og kromosomerne har ikke kondenseret fuldt ud, hvilket gør det vanskeligt at skelne fra hvilefasen.
* Sen profase er meget dynamisk: Når kromosomer kondenseres, nedbrydes atomkonvolutten, spindelfibrene begynder at dannes, og centrosomerne migrerer til polerne. Denne hurtige ændring kan være vanskelig at fange i et enkelt snapshot.
Andre faser har mere forskellige egenskaber:
* Metafase: Kromosomer er indrettet pænt i midten af cellen, hvilket gør dem let genkendelige.
* Anafase: Søsterchromatider adskiller sig og flytter til modsatte poler, tydeligt synlige under et mikroskop.
* Telophase: Nukleare kuvertreformer omkring kromosomerne, og cellen begynder at opdele, hvilket gør denne fase let genkendelig.
Derfor udgør profase, især tidlig profase, den største udfordring til identifikation på grund af dens ligheder med interfase og dens hurtige, dynamiske ændringer.