Proteaser er en forskelligartet gruppe af enzymer, så deres fysiske egenskaber varierer afhængigt af den specifikke protease. Nogle generelle fysiske egenskaber er dog almindelige:
1. Opløselighed:
* De fleste proteaser er opløseligt i vand og findes i de vandige miljøer i celler.
* Nogle proteaser er membranbundet , hvilket betyder, at de er indlejret i cellemembraner og har en mere hydrofob karakter.
2. Molekylvægt:
* Molekylvægten af proteaser varierer meget, lige fra et par tusinde daltoner til over 100.000 daltoner .
* Denne forskel i størrelse kan påvirke deres aktivitet, stabilitet og evne til at få adgang til forskellige underlag.
3. PH Optimum:
* Proteaser har en optimal pH hvor de udviser maksimal aktivitet.
* Denne optimale pH kan variere meget afhængigt af den specifikke protease og dens funktion.
* F.eks. Har Pepsin, en maveprotease, en optimal pH på omkring 2, mens Trypsin, en pancreasprotease, har en optimal pH på omkring 8.
4. Temperaturoptimum:
* Proteaser har også en optimal temperatur hvor de fungerer bedst.
* Ligesom PH varierer denne optimale temperatur afhængigt af protease.
* De fleste proteaser er følsomme over for høje temperaturer , som kan denaturere og inaktiver dem.
5. Stabilitet:
* Proteaser kan variere i deres stabilitet Afhængig af faktorer som pH, temperatur og tilstedeværelsen af hæmmere.
* Nogle proteaser er ret stabile under en lang række forhold, mens andre er mere følsomme over for ændringer i deres miljø.
6. Specificitet:
* Proteaser er meget specifikke I deres handling, hvilket betyder, at de kun spalter peptidbindinger ved specifikke aminosyresekvenser.
* Denne specificitet bestemmes af det aktive sted for protease, som har en unik form og ladningsfordeling, der supplerer målsekvensen.
7. Katalytisk mekanisme:
* Proteaser anvender forskellige katalytiske mekanismer At spalte peptidbindinger, såsom serinproteaser, cysteinproteaser, aspartiske proteaser og metalloproteaser.
* Disse mekanismer involverer anvendelse af specifikke katalytiske rester og et komplekst samspil mellem interaktioner mellem enzymet og dets substrat.
8. Aktivitet:
* Proteaser kan aktiveres ved forskellige mekanismer, såsom proteolytisk spaltning eller binding til cofaktorer.
* Deres aktivitet kan også inhiberes hæmmes af specifikke hæmmere, der binder til det aktive sted eller andre kritiske regioner i enzymet.
Bemærk: Dette er bare generelle egenskaber, og de specifikke egenskaber ved hver protease kan variere betydeligt.