Skovplanter på kanten af ​​tilværelsen i tropisk Afrika

Tropiske regnskove er et af de mest biologisk mangfoldige levesteder på planeten, men beskrivelsen af ​​flora og fauna og forståelsen af ​​deres evolutionære historie er langt fra fuldstændig. Da de er en kilde til bæredygtige ressourcer, herunder potentielle lægemidler, køkken og træ, der er et stigende behov for at vurdere globale biodiversitetsændringer.

GLDAFRICA-projektet valgte at studere en underfamilie af bælgplanterne, Detarioideae, at undersøge artsrigdommens geografiske mønstre. "Ved brug af næste generations sekvensering, vi ønsker at identificere hotspots af evolutionær mangfoldighed og nylige artsdannelsesbegivenheder i det vestlige centrale Afrika, " skitserer Dr. Felix Skov, projektkoordinator.

Konstruerer grenene for at nå frem til træet

Udtrækning af passende DNA-sekvenser fra nogle få plastidmarkører, holdet brugte standardmetoder til at rekonstruere de evolutionære eller fylogenetiske forhold mellem medlemmerne af gruppen. "Vi brugte derefter det resulterende træ til at undersøge de biogeografiske mønstre og biomeskift inden for underfamilien, " fortsætter Dr. Forest. Biomer har en bredere rækkevidde end levesteder, være fællesskaber, der har tilpasset sig som reaktion på et fælles fysisk klima.

Det næste skridt var at indsamle meget flere DNA-sekvensdata, hvilket skulle resultere i et mere detaljeret fylogenetisk træ. Stipendiat med GLDAFRICA-projektet, Dr Manuel de la Estrella, udviklet en målrettet berigelsestilgang, der muliggør et bedre opløst træ med mere detaljerede evolutionære relationer. "Resultatet var, at vi kunne sekventere et par hundrede markører fra kernen. Analyser er i gang, og det nye træ forventes inden for de næste par måneder, "Dr. Forest informerede os.

Et nøgleresultat indtil videre er, at arbejdet er blevet brugt som bevis for en ny klassificering i bælgplanteunderfamilien. "Stammen Detarieae er blevet opgraderet til underfamilieniveau for nylig og hedder nu underfamilien Detarioideae, " forklarer Dr. Forest. "Yderligere analyse vil højst sandsynligt ændre den måde, vi ser på udviklingen af ​​denne vigtige gruppe af vestafrikanske planter."

Ser på fremtidig bevaringsvurdering og trusler mod arter

International Union for Conservation of Nature (IUCN) bevaringsvurderinger er et andet resultat, og "disse vil blive brugt til at producere en [Evolutionært distinkt og globalt truet] EDGE-liste over de mest truede og evolutionært forskellige arter i Detarioideae-gruppen, " fastslår Dr. Forest.

Brug af data kan udvides til forudsigelser om, hvor arten vil ende i træet under forskellige klimaændringsscenarier. "Når alt spadearbejdet er gjort, vi vil bruge artsmodellering og forudsigelser fra det mellemstatslige panel om klimaændringer til at undersøge arternes skæbne i fremtiden."

Mængden af ​​producerede data er langt over, hvad der oprindeligt var forventet for projektet, og teamet arbejder stadig på analysen til de endelige resultater og offentliggørelse. Allerede offentliggjort er to artikler om udviklingen af ​​Detarioideae, en ind Ny fytolog og den anden i International Journal of Plant Sciences .

"GLDAFRICA fokuserede på underfamilien Detarioideae fra Vestafrika. Næste skridt er at udvide denne undersøgelse til de neotropiske arter. Vi har allerede opnået nogle pilotmidler til at udforske gennemførligheden af ​​dette, og det ser meget lovende ud, " slutter Dr. Forest.

Det fylogenetiske træ dyrket fra GLDAFRICA-forskning vil være det mest komplette for en så stor gruppe bælgplanter. I betragtning af den økoøkonomiske betydning af denne gruppe i vestafrikanske regnskove, det vil tjene som grundlag for mange evolutionære undersøgelser, der vil se nærmere på evolutionen og økologien af ​​disse fantastiske økosystemer.