Når stomata er åbne, kan luft komme ind i bladet og diffundere ind i de intercellulære rum i den svampede mesofyl. Disse luftrum er forbundet med xylem- og floemkarrene, der transporterer vand og næringsstoffer gennem bladet. Luftrummene giver også en vej for diffusion af kuldioxid og ilt, som er afgørende for henholdsvis fotosyntese og respiration.
Åbningen og lukningen af stomata styres af beskyttelsesceller, som er specialiserede celler, der omgiver stomien. Når beskyttelsescellerne er fyldige, er stomien åben, og når beskyttelsescellerne er slappe, er stomien lukket. Beskyttelsescellernes turgiitet reguleres af flere faktorer, herunder koncentrationen af kuldioxid i atmosfæren, lysintensiteten og bladets vandstatus.