Videnskab
 Science >> Videnskab >  >> Biologi

Samling af transkriptomet af et skadeligt ukrudt:Nye ressourcer til at studere, hvordan planter invaderer

Titel: Samling af transkriptomet af et skadeligt ukrudt:Nye ressourcer til at studere, hvordan planter invaderer

Abstrakt:

*Invasive planter* er ikke-hjemmehørende arter, der spredes hurtigt og negativt påvirker økosystemer, landbrug og menneskers sundhed. At forstå de molekylære mekanismer, der ligger til grund for deres succes, er afgørende for at udvikle effektive ledelsesstrategier. *Ambrosia artemisiifolia* (almindelig ambrosie) er et skadeligt ukrudt hjemmehørende i Nordamerika, som har invaderet mange dele af verden og forårsaget betydelige økonomiske og sundhedsmæssige byrder. Her rapporterer vi om *de novo* forsamlingen af ​​*A. artemisiifolia* transkriptom ved hjælp af Illumina kortlæst sekventering. Vores samling gav et transkriptom af høj kvalitet med over 100.000 transskriptioner og en BUSCO fuldstændighedsscore på 97,1 %. Vi annoterede transkriptomet ved hjælp af forskellige databaser og identificerede formodede ortologer for gener involveret i vigtige biologiske processer, herunder fotosyntese, stressrespons og reproduktion. Vores transkriptomdata giver en værdifuld ressource til yderligere undersøgelser af den molekylære økologi, evolution og forvaltning af *A. artemisiifolia* og andre invasive planter.

Søgeord: *Ambrosia artemisiifolia*, transkriptomsamling, genekspression, invasive planter, molekylær økologi

Varme artikler